BIOLOGI SEL MOLEKULER & MIKROBIOLOGI (Nilai 12)
1.
Seorang penggemar anjing
ingin mengetahui penyebab tumor pada ketiga ekor anjingnya. Anjing A memiliki
tumor telinga (ear), anjing B tumor
kaki (paw), dan anjing C memiliki
tumor ekor (tail). Kemudian dia
berkonsultasi pada Tobi, temannya seorang ahli biologi, dan Tobi dengan segera
melakukan eksperimen untuk mengetahui penyebab tumor pada ketiga anjing
temannya itu. Tobi mengambil sel-sel dari ketiga anjing tersebut termasuk
sel-sel pada pipi anjing untuk dijadikan kontrol dan dikultur pada cawan Petri. Semua kultur yang berasal dari sel pipi tumbuh satu lapis, tetapi semua
kultur sel tumor menunjukkan adanya tumpukan.
Yang manakah dari ciri-ciri berikut ini yang tidak dimiliki oleh sel-sel
tumor sebagai hasil dari perbedaan pertumbuhan di atas?
A.
Hidrolisis ATP
B.
Contact inhibition
C.
G5 processing
D.
Retinoblastoma
E.
Kaskade
sinyal
2. Berkaitan dengan
No.1, untuk
menentukan penyebab tumor pada masing-masing anjing, Tobi melakukan eksperimen
sebagai berikut.
Berdasarkan data tersebut, secara
berturut-turut tumor-tumor manakah yang memiliki mutasi pada gen supressor
tumor dan tumor-tumor manakah yang memiliki mutasi pada onkogen?
A. Cheek - Ear
B. Ear - Paw
C. Paw - Ear
D. Tail - Cheek
3.
Tomi bekerja di suatu
laboratorium biologi molekuler dan meneliti gen cyclin yang berperan dalam siklus sel. Dia ingin memperbanyak
dengan PCR dan mengurutkannya baik yang berasal dari sel-sel normal (wild-type) dari mencit maupun dari
sel-sel tumor (sakit). Gen cyclin
ditunjukkan pada gambar di bawah ini. Ekson dinyatakan dengan sejumlah kotak
dan urutan terminal diperbesar dengan dicetak tebal.
Primer
manakah yang sebaiknya digunakan dalam reaksi sekuensing untuk memperoleh
urutan yang paling sama dengan mRNA (rantai pengkode)?
- 1
- 2
- 3
- 4
4.
Agi
mempelajari bagaimana gen tat pada
HIV bekerja sehingga dia dapat mendesain suatu obat untuk melawan infeksi HIV.
Dia menemukan bahwa sel-sel yang terinfeksi oleh HIV wild-type menghasilkan RNA
virus berukuran panjang yang mampu berhibridisasi dengan probe DNA virus A, B
dan C seperti gambar berikut. Sebaliknya, sel-sel yang terinfeksi dengan mutan tat- menghasilkan RNA virus
lebih pendek yang hanya mampu berhibridisasi dengan probe A.
Manakah dari pernyataan berikut yang
tepat berdasarkan hasil observasi di atas?
A.
Produk gen tat
memungkinkan RNA polymerase untuk mentranskripsi melalui suatu terminator
transkripsional yang berada pada DNA di antara probe A dan B.
B.
Produk gen tat penting untuk inisiasi transkripsi.
C.
Produk gen tat penting untuk
inisiasi translasi mRNA sense (+)
.
D.
Pada mutan tat, suatu insersi
nukleotida tunggal menyebabkan perubahan kerangka baca (frameshift) dan merubah DNA hilir (downstream) sehingga tidak dapat berhibridisasi dengan probe B dan
C
5.
Seorang ilmuwan
melakukan percobaan untuk memisahkan membran dalam dari mitokondria. Setelah
membran dalam terpisah, membran dalam tersebut kemudian diberikan perlakuan
tertentu sehingga F1 dari ATP sintetasenya rusak. Dari semua proses berikut:
1. Oksidasi NADH
2. Produksi H2O dari O2
3. Terbentuknya gradien proton
4. Posporilasi ADP
Manakah yang tidak akan terjadi akibat perlakuan
tersebut? (point 1)
A. 1,2,3,4
B. 2,4
C. 1,3,2
D. 4 saja
E. 3 saja
6.
Atenuasi merupakan
salah satu proses pengaturan pada Trp operon dari bakteri. Sistem ini diatur
pada Trp E dari Trp operon. Trp E merupakan gen paling awal (upstream) dari Trp operon. Trp E ini
ditanskripsi baik ketika terdapat triptofan maupun tidak. Apabila terdapat
triptofan maka Trp E yang telah ditranskripsi selanjutnya akan ditranslasi oleh
ribosom, akibatnya akan terbentuk terminasi trankripsi sehingga gen-gen lain
dari Trp operon tidak di transkripsi. Tapi apabila tidak terdapat triptofan,
maka ribosom akan berhenti pada kodon yang mengkode tripotofan. Akibatnya
translasi dari Trp E akan terhenti dan proses trankripsi dapat dilanjutkan
sampai akhir (semua gen pada Trp operon di transkripsi). Berdasarkan keterangan
tersebut, maka pernyataan manakah yang salah mengenai sistem atenuasi dan Trp
operon?
A. Proses atenuasi terjadi di dalam
sitoplasma
B. Karena ribosom terhenti pada Trp E maka
gen-gen lain dari Trp operon baru akan di translasi apabila terdapat triptofan
di dalam sitoplasma.
C. Hasil transkripsi dari Trp operon bersifat
polisistronik.
D. Atenuasi berfungsi untuk mencegah
diproduksinya enzim yang mensintesis triptofan ketika kadar triptofan didalam
sel sangat banyak
E. Semua jawaban diatas adalah benar.
7.
Anda memiliki satu
tabung berisi sel E. coli pada konsentrasi 106/ml.
Dengan mengasumsikan bahwa kultur mengandung 50% sel hidup dan anda
mengencerkan kultur dengan 10-4, berapa banyak koloni yang anda
harapkan akan diperoleh pada suatu cawan per 1 ml dari pengenceran 10-4?
A.
5
B.
500
C.
50
D.
100
E.
5000
8.
Anda
menginokulasi kultur Escherichia coli pada tabung Erlenmeyer yang berisi
medium segar pada pukul 7:00 pagi hingga diperoleh kerapatan sel sebesar 105
sel/ml. Setelah fase lag 2 jam, sel-sel tumbuh secara eksponensial
hingga siang hari (pukul 12.00) dengan kerapatan sel menjadi 108
sel/ml. Berdasarkan informasi tersebut, berapakah perkiraan waktu
generasi kultur E. coli ini? (g = t/n)
A.
1 jam
B.
3 jam
C.
0.1 jam
D.
2.2 jam
E.
0.3 jam
9.
Anda merencanakan
untuk melakukan isolasi gen tertentu dari mikroba yang belum teridentifikasi
pada pustaka gen dari 15.000 klon individual Escherichia coli yang berada pada vektor kloning plasmid dengan
panjang rata-rata DNA insert 4 kb. Informasi tambahan diperoleh dari temanmu
yang memberi tahu bahwa mikroba ini memiliki genom sekitar 12.000.000 bp,
sebaliknya ukuran rata-rata genom bakteri sebesar 4.000.000 bp. Manakah
perubahan berikut yang dapat anda terapkan pada rencana anda untuk mengurangi
usaha yang diperlukan untuk mengidentifikasi gen ini?
A. Mengisolasi lebih dari 15.000 klon E. coli.
B. Menukar dengan inang kloning yang berbeda.
C. Mengisolasi fragmen DNA yang ukurannya lebih besar.
D.
Menggunakan cawan
petri yang berukuran lebih besar.
Pertanyaan No. 10-12 berkaitan
dengan keterangan berikut ini.
Gambar berikut ini menggambarkan
tiga tipe utama dari transfer gen. Gunakan huruf yang berhubungan untuk
menjawab pertanyaan berikut ini.
Catatan: molekul DNA sirkuler pada (C) bisa berupa plasmid yang bebas
bereplikasi atau bisa juga plasmid yang terintegrasi ke dalam kromosom.
10.
Proses
mana yang dapat mentransfer gen resisten antibiotik?
11.
Proses
mana yang dapat mentransfer gen-gen kromosom?
12.
Proses
mana yang dapat melibatkan suatu origin
of transfer (oriT)?
